MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA518

Total Repeats: 386

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017495	TCAAT	2	10	179	188	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017495	A	7	7	228	234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017495	A	7	7	236	242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017495	TAT	2	6	252	257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017495	AT	3	6	256	261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017495	TA	3	6	268	273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017495	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017495	GAG	2	6	319	324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017495	ATA	2	6	441	446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017495	A	6	6	458	463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017495	AAC	2	6	538	543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836840
12	NC_017495	GGT	2	6	561	566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836840
13	NC_017495	A	6	6	587	592	100 %	0 %	0 %	0 %	385836840
14	NC_017495	GTG	2	6	598	603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836840
15	NC_017495	ATA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836840
16	NC_017495	AAAG	2	8	726	733	75 %	0 %	25 %	0 %	385836840
17	NC_017495	ATT	2	6	735	740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836840
18	NC_017495	CTTT	2	8	743	750	0 %	75 %	0 %	25 %	385836840
19	NC_017495	TAG	2	6	762	767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836840
20	NC_017495	AAG	2	6	785	790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836840
21	NC_017495	AAGC	2	8	808	815	50 %	0 %	25 %	25 %	385836840
22	NC_017495	ATG	2	6	902	907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836840
23	NC_017495	AGTAT	2	10	1010	1019	40 %	40 %	20 %	0 %	385836840
24	NC_017495	CGGA	2	8	1080	1087	25 %	0 %	50 %	25 %	385836840
25	NC_017495	GCGA	2	8	1140	1147	25 %	0 %	50 %	25 %	385836840
26	NC_017495	A	6	6	1203	1208	100 %	0 %	0 %	0 %	385836840
27	NC_017495	GAA	2	6	1216	1221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836840
28	NC_017495	AC	3	6	1230	1235	50 %	0 %	0 %	50 %	385836840
29	NC_017495	AAAG	2	8	1260	1267	75 %	0 %	25 %	0 %	385836840
30	NC_017495	GAA	2	6	1305	1310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836840
31	NC_017495	ATGA	2	8	1459	1466	50 %	25 %	25 %	0 %	385836840
32	NC_017495	TAT	2	6	1467	1472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836840
33	NC_017495	AGA	2	6	1499	1504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836840
34	NC_017495	A	6	6	1585	1590	100 %	0 %	0 %	0 %	385836840
35	NC_017495	A	6	6	1627	1632	100 %	0 %	0 %	0 %	385836840
36	NC_017495	TACC	2	8	1645	1652	25 %	25 %	0 %	50 %	385836840
37	NC_017495	TGAG	2	8	1680	1687	25 %	25 %	50 %	0 %	385836840
38	NC_017495	TGA	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836841
39	NC_017495	A	8	8	1771	1778	100 %	0 %	0 %	0 %	385836841
40	NC_017495	A	7	7	1782	1788	100 %	0 %	0 %	0 %	385836841
41	NC_017495	GTA	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836841
42	NC_017495	A	7	7	1882	1888	100 %	0 %	0 %	0 %	385836841
43	NC_017495	A	7	7	1893	1899	100 %	0 %	0 %	0 %	385836841
44	NC_017495	A	8	8	1915	1922	100 %	0 %	0 %	0 %	385836841
45	NC_017495	A	7	7	1926	1932	100 %	0 %	0 %	0 %	385836841
46	NC_017495	ATG	2	6	1935	1940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836841
47	NC_017495	TTA	2	6	1961	1966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836841
48	NC_017495	AAG	2	6	1986	1991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836841
49	NC_017495	TTG	2	6	2003	2008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836841
50	NC_017495	CAA	2	6	2045	2050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836841
51	NC_017495	GAA	2	6	2081	2086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836841
52	NC_017495	ATAAA	2	10	2214	2223	80 %	20 %	0 %	0 %	385836841
53	NC_017495	GAA	2	6	2231	2236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836841
54	NC_017495	AAT	2	6	2240	2245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836841
55	NC_017495	A	6	6	2255	2260	100 %	0 %	0 %	0 %	385836841
56	NC_017495	TTC	2	6	2338	2343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017495	T	8	8	2466	2473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017495	TC	3	6	2476	2481	0 %	50 %	0 %	50 %	385836842
59	NC_017495	TTGT	2	8	2486	2493	0 %	75 %	25 %	0 %	385836842
60	NC_017495	T	6	6	2493	2498	0 %	100 %	0 %	0 %	385836842
61	NC_017495	CTGA	2	8	2507	2514	25 %	25 %	25 %	25 %	385836842
62	NC_017495	CTG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836842
63	NC_017495	T	6	6	2738	2743	0 %	100 %	0 %	0 %	385836842
64	NC_017495	ACCG	2	8	2793	2800	25 %	0 %	25 %	50 %	385836842
65	NC_017495	CAA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836842
66	NC_017495	CGA	2	6	2870	2875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836842
67	NC_017495	TCA	2	6	2887	2892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836842
68	NC_017495	T	6	6	2942	2947	0 %	100 %	0 %	0 %	385836842
69	NC_017495	CTG	2	6	2976	2981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836842
70	NC_017495	TGA	2	6	2990	2995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836842
71	NC_017495	GCT	2	6	3014	3019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836842
72	NC_017495	GTT	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836842
73	NC_017495	TGA	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836842
74	NC_017495	CATA	2	8	3425	3432	50 %	25 %	0 %	25 %	385836842
75	NC_017495	AT	3	6	3460	3465	50 %	50 %	0 %	0 %	385836842
76	NC_017495	TAG	2	6	3539	3544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836842
77	NC_017495	AT	3	6	3589	3594	50 %	50 %	0 %	0 %	385836842
78	NC_017495	AAC	2	6	3678	3683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836842
79	NC_017495	CAA	2	6	3717	3722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836842
80	NC_017495	GCCAAA	2	12	3733	3744	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385836842
81	NC_017495	CCA	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836842
82	NC_017495	ATT	2	6	3826	3831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836842
83	NC_017495	ATT	2	6	3924	3929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836843
84	NC_017495	T	6	6	3938	3943	0 %	100 %	0 %	0 %	385836843
85	NC_017495	T	7	7	3959	3965	0 %	100 %	0 %	0 %	385836843
86	NC_017495	T	6	6	4012	4017	0 %	100 %	0 %	0 %	385836843
87	NC_017495	AGCA	2	8	4070	4077	50 %	0 %	25 %	25 %	385836843
88	NC_017495	TCTTT	2	10	4104	4113	0 %	80 %	0 %	20 %	385836843
89	NC_017495	CGT	2	6	4114	4119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836843
90	NC_017495	A	6	6	4125	4130	100 %	0 %	0 %	0 %	385836843
91	NC_017495	CCA	2	6	4136	4141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836843
92	NC_017495	ACC	2	6	4153	4158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836843
93	NC_017495	CAA	2	6	4261	4266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836843
94	NC_017495	T	7	7	4315	4321	0 %	100 %	0 %	0 %	385836843
95	NC_017495	T	7	7	4327	4333	0 %	100 %	0 %	0 %	385836843
96	NC_017495	CATA	2	8	4396	4403	50 %	25 %	0 %	25 %	385836843
97	NC_017495	AT	3	6	4407	4412	50 %	50 %	0 %	0 %	385836843
98	NC_017495	CGCT	2	8	4429	4436	0 %	25 %	25 %	50 %	385836843
99	NC_017495	CGT	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836843
100	NC_017495	GAC	2	6	4748	4753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836843
101	NC_017495	CGA	2	6	4776	4781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836843
102	NC_017495	T	6	6	4788	4793	0 %	100 %	0 %	0 %	385836843
103	NC_017495	TCA	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836843
104	NC_017495	TCA	2	6	4923	4928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836843
105	NC_017495	TCA	2	6	4947	4952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836843
106	NC_017495	TA	4	8	5003	5010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017495	CACC	2	8	5078	5085	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_017495	GTG	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017495	ATT	2	6	5108	5113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017495	G	6	6	5116	5121	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017495	CACT	2	8	5122	5129	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017495	TCT	2	6	5275	5280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836844
113	NC_017495	AGTA	2	8	5327	5334	50 %	25 %	25 %	0 %	385836844
114	NC_017495	ATC	2	6	5397	5402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836844
115	NC_017495	ACG	2	6	5452	5457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836844
116	NC_017495	TAAA	2	8	5462	5469	75 %	25 %	0 %	0 %	385836844
117	NC_017495	ACC	2	6	5615	5620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017495	A	6	6	5666	5671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017495	GA	3	6	5672	5677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017495	T	6	6	5713	5718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017495	TCT	2	6	5722	5727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017495	GTT	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017495	GAA	2	6	5744	5749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017495	TTTTA	2	10	5752	5761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017495	T	8	8	5764	5771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017495	TAAAA	2	10	5779	5788	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017495	GAAA	2	8	5849	5856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017495	ATTTTT	2	12	5860	5871	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017495	CGA	2	6	5976	5981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017495	A	7	7	5985	5991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017495	ATT	2	6	5993	5998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017495	CAA	2	6	6047	6052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017495	ATA	2	6	6093	6098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017495	TGA	2	6	6156	6161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017495	CAG	2	6	6245	6250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017495	TTA	2	6	6251	6256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017495	ATC	2	6	6261	6266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017495	ATA	2	6	6271	6276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017495	A	6	6	6331	6336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017495	TGT	2	6	6351	6356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017495	GTT	2	6	6383	6388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017495	TA	3	6	6405	6410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017495	TAA	2	6	6417	6422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_017495	ATCT	2	8	13017	13024	25 %	50 %	0 %	25 %	385836850
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386	NC_017495	ATT	2	6	17647	17652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.